Байкальская нерпа (Pusa sibirica Gmel.) - единственный представитель млекопитающих в озере. По классификации нерпа относится к семейству настоящих тюленей (Phocidae), роду Pusa. Исследователи счтают, что байкальская нерпа произошла от общего с кольчатым северным тюленем предка. Предполагают, что нерпа проникла из Ледовитого океана по Енисею и Ангаре в Ледниковый период, когда реки были подпружены льдами, надвигающимися с севера. В середине 80-ых в Байкале насчитывалось около 70 тыс. голов нерпы.
Предельный возраст байкальской нерпы (по В.Д.Пастухову) 56 лет для самок и 52 года для самцов. Детородный возраст длится с 4-7 до 40 лет, беременность длится 11 месяцев. За жизнь самка может принести более 20 детёнышей. Средний вес нерпы в Байкале около 50 кг, максимальный вес самцов 130-150 кг, длина 1,7-1,8 м. Самки по размерам меньше - 1,3-1,6 м и до 110 кг.